林口長庚紀念醫院基因醫學核心實驗室 | 獸醫院評價網
![林口長庚紀念醫院基因醫學核心實驗室](https://i.imgur.com/3Y1GYCf.jpg)
主要服務的研究方向為:以RNA導向的基因表現分析,與以分析基因體來探討疾病相關之基因變異。「基因醫學核心實驗室」的使命為:(1)提供長庚紀念醫院及長庚大學研究人員一 ...
![林口長庚紀念醫院基因醫學核心實驗室](https://i.imgur.com/3Y1GYCf.jpg)
主持人:鐘文宏醫師 組成、宗旨與目標 「基因醫學核心實驗室」於106年1月1日開始展開服務。 「基因醫學核心實驗室」整合了原有的基因定序核心實驗室、基因體核心實驗室與生物資訊核心實驗室。主要服務的研究方向為:以RNA導向的基因表現分析,與以分析基因體來探討疾病相關之基因變異。 「基因醫學核心實驗室」的使命為: (1)提供長庚紀念醫院及長庚大學研究人員一套最新型的基因醫學研究設備, (2)協助長庚體系研究者設計基因醫學實驗及透過生物資訊提供資料分析諮詢服務, (3)提供長庚體系研究員及學生基因醫學教育及技術訓練, (4)建立一個可供各領域研究者討論及建立合作的開放論壇。 核心技術 1. Illumina MiSeq System Illumina MiSeq定序儀為桌上型定序儀。在提供一貫優良品質數據的前提下,使用者可依據實驗所需及預算考量彈性選擇多種不同定序通量及讀長。依據MiSeq可提供高通量定序資料的特性,最適合本機的定序實驗為小型基因體定序(細菌、病毒)、16S Metagenomics菌相分析、目標基因群序列分析(amplicon, gene panel)、染色質免疫沉澱片段定序、微型RNA定序及甲基化序列分析等。 隨著倍增的基因定序資料與日益龐大的基因體資料庫,日趨複雜的生物醫學研究實驗設計中,後端資料整理、分析以及研究疾病的關聯性的比重將顯著增加。生物資訊學乃是一個結合生物學、計算機科學及資訊科技所形成的新研究領域,最終的目標是發現新的生物認知,進而建立生物系統的整體概念。次世代定序分析即是以資訊學的方式整合不同層面的海量數據(Big Data)幫助研究者更進一步了解基因體變異疾病的致病因子及其機制。次世代定序產生的大量定序資料(原始檔案格式FASTQ檔),須藉由電腦程式運算進行分析,初步的定序分析皆以序列比對與變異點辨認為主,一般採用常見的序列比對程式bwa、bowtie、bowtie2,完成後寫入BAM檔,再以變異點辨認程式gatk、freebayes等分為單點變異(SNP)與小片段變異(INDEL)兩種型態辨認,同時會計...
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